Спойлеры к третьей книге "Крипт Терры" - Тёмный город
После событий «Полой горы» инквизитор Эразм Кроул пропадает. Его дознаватель, Спиноза, берет на себя командование свитой инквизитора и проводит большую часть книги, пытаясь найти Кроула, раскрыть все, что осталось от заговора, пережить апокалиптические беспорядки на Терре, избежать попыток покушения со стороны верховного инквизитора и сохранить свиту. В конце концов они выясняют, что последний заговорщик (третий Высший Лорд, Генерал-Фабрикатор Адептус Механикус) построил… врата Паутины. 
После попытки добраться до Марса, куда, по их мнению, отбыл Генерал-фабрикатор, они понимают, что он на самом деле перенес проект на Луну. Объединившись с другим Инквизитором, Зиесом, (в основном против его воли), они добираются до Луны и находят не только портал в Паутину, но и Кроула — теперь уже на грани безумия, умирающего от "Болезни Будущего" и зараженного кровью гомункула. В этот момент прибывает Наврадаран из Адептус Кустодес со своим воинством и полком Милитарум, и все они атакуют портал Паутины.
После ужасающего и смертельного путешествия через паутину связь Кроула с гомункулом обеспечивает им безопасный доступ к месту встречи Механикус-Друкари. Кустодес и Инквизиция, наконец, узнают секрет, который Механикус скрывали веками — Золотой Трон сломан. В обмен на принесение в жертву друкари целой системы — 19 миллиардов душ — эльдары дадут им компоненты, необходимые для починки Трона. 
Кроул ускользает, использует волшебный портал-зеркало, чтобы путешествовать по всей Паутине, и узнает настоящую причину, по которой друкари помогают Империуму; Комморра ведет собственную Войну Паутины против бесконечной армии демонов, и они построили собственный Трон, чтобы закрыть брешь. Но чтобы это сработало, им нужен могущественный псайкер, и ради собственной безопасности они разорвали собственную связь с варпом. Большое открытие состоит в том, что друкари собираются использовать биологические образцы Императора, взятые из запасных частей Трона, для клонирования собственного Императора.
Кроул срывает передачу и рассказывает всю правду. Есть фантастический момент, когда Кустодес физически прикрывает Кроула, чтобы он мог говорить. Конечно кустодес не рады узнать, что их хозяин будет клонирован ксеносами, чтобы его вечно пытали, чтобы сохранить их королевство. Сделка срывается, Наврадаран и его воинство остаются и приказывают инквизиторам бежать и предупредить Империум.
И тут персонажи трилогии начинают погибать. Ревус и Казад, Капитан Штурмовиков и Убийца Культа Смерти, оказываются отрезаными и гибнут, сражаясь — «Наши дети были бы грозными» — мощный взрыв на месте встречи знаменует собой гибель войска Наварадарана и генерала-фабрикатора. Кроул, умирая, остается и взрывает гомункула, преследовавшего его с первой книги. Спиноза и Зиес продолжают сражаться, теряя людей, пока инквизитор не оказывается в плену, и Спиноза не казнит его из милосердия. Но это нормально, потому что Спиноза почти у ворот паутины. Она ранена, она ползет, она почти добралась. Империум должен быть предупреждён, это всё, что беспокоит её. 
Но у неё не получается, она погибает. 
В эпилоге мы снова возвращаемся на Терру, где представитель Инквизиции скрывают всё произошедшее. Заговор, в котором участвуют три Верховных Лорда и миллионы – миллиарды – погибших, всё будет хранится в архиве до тех пор, пока кто-нибудь не найдет время, чтобы всё это раскопать. Но никто не будет искать. Есть более важные вещи, на которых стоит сосредоточиться… например, возвращение Робаута Жиллимана.
Последний поворот сюжета заключается в том, что серво-череп Кроула прошел через портал, и он все это время записывал. Но он поврежден, у него мало энергии, и он находится на экзодитском мире. Предупреждение у него, но его никто не найдет. Никто не ищет.
Конец.